Madrasah Tsanawiyah Satu Atap (MTS SA Al-Istiqomah) termasuk MTS Binaan pemerintah dibawah naungan yayasan Pendidikan Islam Al-Istiqomah yang didirikan pada tahun 2009, dengan No. Izin Oprasional Kw. 10.4/ 4/ PP.00.5/ 7807/ 2009. Tgl 22 Oktober 2009 dengan No. Statistik Madrasah 121232030093 yang mendapatkan Block Grand dari pemerintah sehingga terbangunnya MTs SA Al- Istiqomah dengan Fasilitas yang bisa dibanggakan.
MTS SA AL-ISTIQOMAH Terakreditasi A dan siap membina putra putri dengan landasan keimanan, keilmuan, dan keterampilan agar menjadi generasi bangsa yang tangguh, berkualitas, dan dapat mengamalkan ilmunya yang berguna bagi dirinya sendiri maupun bagi masyarakat sekitarnya.
Untuk meningkatkan keimanan tersebut, serta menanamkan akhlaqul karimah, para siswa dibekali dengan pembinaan rohani, praktik ibadah serta tata tertib madrasah.
Membina keterampilan para siswa melalui kegiatan praktek komputer, percakapan bahasa inggris, bahasa arab, dakwah islam dan olahraga.
Muatan lokal unggulan di Mts SA Al-Istiqomah adalah metode amtsilati yaitu metode cara cepat dalam menguasai dan membaca kitab kuning dan muhadatsah bahasa arab.
